El campo de la microbiología puede ser dividido en varias subdisciplinas:
1.Fisiología microbiana: estudio a nivel bioquímico del funcionamiento de las células microbianas. Incluye el estudio del crecimiento, el metabolismo y la estructura microbianas.
2.Genética microbiana: estudio de la organización y regulación de los genes microbianos y como éstos afectan el funcionamiento de las células. Está muy relacionada con la biología molecular.
3. Microbiología clínica: estudia la morfología de los microbios.
4. Microbiología médica: estudio del papel de los microbios en las enfermedades humanas. Incluye el estudio de la pato-génesis microbiana y la epidemiología y está relacionada con el estudio de la patología de la enfermedad y con la inmunología.
5. Microbiología veterinaria: estudio del papel de los microbios en la medicina veterinaria.
6. Microbiología ambiental: estudio de la función y diversidad de los microbios en sus entornos naturales. Incluye la ecología microbiana, la geomicrobiología, la diversidad microbiana y labiorremediación.
7. Microbiología evolutiva: estudio de la evolución de los microbios. Incluye la sistemática y la taxonomía bacterianas.
8.Microbiología industrial: estudia la explotación de los microbios para uso en procesos industriales. Ejemplos son la fermentación industrial y el tratamiento de aguas residuales. Muy cercana a la industria de la biotecnología.
9. Aeromicrobiología: estudio de los microorganismos transportados por el aire.
10. Microbiología de los alimentos: estudio de los microorganismos que estropean los alimentos.
11. Microbiología espacial: Estudio de los microorganismos presentes en el espacio extraterrestre, en las estaciones espaciales, en las naves espaciales.
Los Reinos de la Microbiología
Reino Monera: Estos organismos son conocidos por ser bacterias unicelulares, es decir que están formadas por una sola célula; las bacterias se encuentran en todas partes, pero son tan pequeñas, que para verlas se necesita la ayuda de un microscopio.
Hay muchas clases de bacterias, y muchas de ellas viven en el suelo y ademas son descomponedoras de materia orgánica. Algunas viven en el estómago de los animales y allí descompone todo lo que se comen, e incluso en las vacas, cuando estas ingieren el pasto, este se descomponen, debido a que estos animales se les convierten en nutrientes. Otras descomponen la leche y, por eso, el hombre aprendió a utilizarlas para elaborar kumis y yogur.
Estas bacterias son capaces de vivir sin oxígeno, como las que habitan en alcantarillados y pantanos produciendo gas metano y las que viven en el tubo digestivo de animales.
Reino Fungí: También conocido como el reino hongo, (Derivado de Latín que sería "Hongo") está formado por organismos macroscópicos (que se pueden ver a simple vista) y en su mayoría pluricelulares (pero sin tejidos)eucariotas y heterotrófos (Que no fabrican su propio alimento).Los representantes más conocidos son el pan.
Se estudian principalmente dentro de la micología dedicada al estudio de los hongos. Su estructura es variada ya que hay tres clase de hongos como estos:
1.Moho:El moho es un hongo que se encuentra al aire libre como en lugares húmedos y con baja luminosidad.
Así se ve un pan cuando se deja a la imterperie el moho se va reproduciedo lentamente y apesar de que no lo veamos produciendo y se que se transportan en el aire lamandolos esporas ; estas partículas microscópicas son tan pequeñas que son invisibles al ojo humano y se encuentran en casi todos lados. Cuando dejas el pan en la mesada, las esporasaterrizan en él y, con el tiempo y temperaturas cálidas suficientes, crecerán y se convertirán en hongos. Las esporas obtienen la energía que necesitan para crecer al alimentarse del pan.